インボイス登録に係る通知時期の目安について、国税庁は10月15日にインボイス特設サイトで、e-Tax による提出では約２か月、書面による提出では約2.5か月を要し、申請書に記載漏れ等があればさらに時間がかかることを示した。インボイス登録に係る通知が届くまでに一定期間を要するため、登録日から登録の通知を受けるまでの間に生じた取引については売手・ 買手双方で対応が必要となる。
　同特設サイトでは、登録日から実際に通知を受けるまでの間に取引を行う場合の対応について、インボイス制度に関するQ&Aのうち２問掲載している。登録日から登録の通知を受けるまでの間の取扱いについて、既に請求書を交付した場合には通知後にインボイスの記載事項を満たした請求書を改めて交付する必要があるが、既に交付した請求書との関連性が明確等であれば、インボイスの記載事項として不足する内容を書面等で通知する方法もある(問36、消基通1-7-3)。
　また、新設法人が事業開始日の属する課税期間の初日から登録を受ける旨を記載した申請書を、その課税期間の末日までに提出して登録を受けた場合には、課税期間の初日に登録を受けたものとみなされるため (消令70の4、消規26の4等)、通知後にインボイスを交付する等の対応が考えられる。しかし、不特定多数の者に販売する小売店等の事業者は事後交付が困難な場合があるため、事前に交付が遅れる旨を周知した上で、ホームページ等に登録番号を掲示する方法もある(問37)。買手側も、売手がインボイス発行事業者の登録を受ける旨を事前に確認できていれば、事後交付されたインボイス等を保存することで登録番号のない請求書等の記載金額を基に仕入税額控除を行うことができる。
　登録の処理状況については、各局(所)のインボイス登録センターに問い合わせることが可能だが、国税庁は登録申請者に対し、同問合せは「登録通知時期の目安となる期間を経過後」 に行うよう呼び掛けている。
　

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